Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCO2O43819 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCO2O43819 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCO2O43819 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCO2O43819 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCO2O43819 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCO2O43819 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCO2O43819 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCO2O43819 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCO2O43819 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCO2O43819 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCO2O43819 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCO2O43819 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCO2O43819 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCO2O43819 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCO2O43819 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCO2O43819 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCO2O43819 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCO2O43819 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCO2O43819 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCO2O43819 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCO2O43819 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCO2O43819 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCO2O43819 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCO2O43819 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCO2O43819 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCO2O43819 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCO2O43819 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCO2O43819 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCO2O43819 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCO2O43819 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCO2O43819 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCO2O43819 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCO2O43819 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCO2O43819 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCO2O43819 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCO2O43819 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCO2O43819 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCO2O43819 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCO2O43819 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCO2O43819 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCO2O43819 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCO2O43819 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCO2O43819 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCO2O43819 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCO2O43819 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCO2O43819 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCO2O43819 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCO2O43819 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCO2O43819 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCO2O43819 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCO2O43819 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCO2O43819 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCO2O43819 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCO2O43819 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCO2O43819 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCO2O43819 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCO2O43819 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCO2O43819 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCO2O43819 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCO2O43819 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCO2O43819 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCO2O43819 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SCO2O43819 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCO2O43819 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SCO2O43819 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCO2O43819 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCO2O43819 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCO2O43819 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCO2O43819 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCO2O43819 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SCO2O43819 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCO2O43819 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCO2O43819 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCO2O43819 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCO2O43819 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCO2O43819 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCO2O43819 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCO2O43819 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCO2O43819 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCO2O43819 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCO2O43819 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCO2O43819 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCO2O43819 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCO2O43819 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCO2O43819 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCO2O43819 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCO2O43819 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCO2O43819 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCO2O43819 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCO2O43819 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCO2O43819 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCO2O43819 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCO2O43819 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCO2O43819 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCO2O43819 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCO2O43819 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCO2O43819 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCO2O43819 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCO2O43819 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 262.7 ms