Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD6O43541 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD6O43541 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD6O43541 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms