Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP8B1O43520 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms