Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GOLIM4O00461 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLIM4O00461 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLIM4O00461 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLIM4O00461 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLIM4O00461 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLIM4O00461 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLIM4O00461 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLIM4O00461 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLIM4O00461 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLIM4O00461 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLIM4O00461 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLIM4O00461 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLIM4O00461 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLIM4O00461 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLIM4O00461 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLIM4O00461 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLIM4O00461 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLIM4O00461 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLIM4O00461 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLIM4O00461 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLIM4O00461 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLIM4O00461 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLIM4O00461 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLIM4O00461 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLIM4O00461 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLIM4O00461 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLIM4O00461 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLIM4O00461 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLIM4O00461 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLIM4O00461 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLIM4O00461 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GOLIM4O00461 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
GOLIM4O00461 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms