Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMO7DNF2Z398 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMO7DNF2Z398 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms