Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRIQ3A6PVS8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRIQ3A6PVS8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRIQ3A6PVS8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRIQ3A6PVS8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms