Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZNF233A6NK53 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF233A6NK53 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF233A6NK53 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms