Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC160A6NGH7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC160A6NGH7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms