Protein–RNA interactions for Protein: A6NEV1

PRR23A, Proline-rich protein 23A, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR23AA6NEV1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRR23AA6NEV1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRR23AA6NEV1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRR23AA6NEV1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms