Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT87PA6NCN2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT87PA6NCN2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms