Protein–RNA interactions for Protein: A0A5B9

TRBC2, T-cell receptor beta-2 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC2A0A5B9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRBC2A0A5B9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
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