Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0B3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0B3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
A0A087X0B3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
A0A087X0B3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
A0A087X0B3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
A0A087X0B3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
A0A087X0B3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
A0A087X0B3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms