Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U2

TSSC4, Protein TSSC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC4Q9Y5U2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSC4Q9Y5U2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSC4Q9Y5U2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSC4Q9Y5U2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSC4Q9Y5U2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSSC4Q9Y5U2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSSC4Q9Y5U2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSSC4Q9Y5U2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSSC4Q9Y5U2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSSC4Q9Y5U2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSSC4Q9Y5U2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSSC4Q9Y5U2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSSC4Q9Y5U2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSSC4Q9Y5U2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TSSC4Q9Y5U2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSSC4Q9Y5U2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms