Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL4A3BPQ9Y5P4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL4A3BPQ9Y5P4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL4A3BPQ9Y5P4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
COL4A3BPQ9Y5P4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL4A3BPQ9Y5P4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL4A3BPQ9Y5P4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
COL4A3BPQ9Y5P4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL4A3BPQ9Y5P4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL4A3BPQ9Y5P4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL4A3BPQ9Y5P4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL4A3BPQ9Y5P4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL4A3BPQ9Y5P4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL4A3BPQ9Y5P4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL4A3BPQ9Y5P4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL4A3BPQ9Y5P4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL4A3BPQ9Y5P4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL4A3BPQ9Y5P4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL4A3BPQ9Y5P4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL4A3BPQ9Y5P4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL4A3BPQ9Y5P4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL4A3BPQ9Y5P4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL4A3BPQ9Y5P4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms