Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P4

SLC27A6, Long-chain fatty acid transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A6Q9Y2P4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC27A6Q9Y2P4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC27A6Q9Y2P4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.1 ms