Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SATB2Q9UPW6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SATB2Q9UPW6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SATB2Q9UPW6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms