Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD4AQ9UPU9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SAMD4AQ9UPU9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SAMD4AQ9UPU9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD4AQ9UPU9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms