Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT11Q9UKZ1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT11Q9UKZ1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT11Q9UKZ1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms