Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL0

RCOR1, REST corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR1Q9UKL0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RCOR1Q9UKL0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RCOR1Q9UKL0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RCOR1Q9UKL0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RCOR1Q9UKL0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RCOR1Q9UKL0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RCOR1Q9UKL0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RCOR1Q9UKL0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RCOR1Q9UKL0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RCOR1Q9UKL0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RCOR1Q9UKL0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms