Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PARP4Q9UKK3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PARP4Q9UKK3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
PARP4Q9UKK3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PARP4Q9UKK3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PARP4Q9UKK3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PARP4Q9UKK3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PARP4Q9UKK3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
PARP4Q9UKK3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PARP4Q9UKK3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PARP4Q9UKK3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
PARP4Q9UKK3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
PARP4Q9UKK3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
PARP4Q9UKK3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
PARP4Q9UKK3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PARP4Q9UKK3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PARP4Q9UKK3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PARP4Q9UKK3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PARP4Q9UKK3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
PARP4Q9UKK3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PARP4Q9UKK3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PARP4Q9UKK3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PARP4Q9UKK3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PARP4Q9UKK3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PARP4Q9UKK3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PARP4Q9UKK3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PARP4Q9UKK3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PARP4Q9UKK3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PARP4Q9UKK3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PARP4Q9UKK3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PARP4Q9UKK3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PARP4Q9UKK3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PARP4Q9UKK3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PARP4Q9UKK3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PARP4Q9UKK3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PARP4Q9UKK3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PARP4Q9UKK3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PARP4Q9UKK3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PARP4Q9UKK3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PARP4Q9UKK3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PARP4Q9UKK3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PARP4Q9UKK3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PARP4Q9UKK3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PARP4Q9UKK3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PARP4Q9UKK3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PARP4Q9UKK3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PARP4Q9UKK3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PARP4Q9UKK3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PARP4Q9UKK3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PARP4Q9UKK3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PARP4Q9UKK3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PARP4Q9UKK3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PARP4Q9UKK3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PARP4Q9UKK3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PARP4Q9UKK3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PARP4Q9UKK3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PARP4Q9UKK3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PARP4Q9UKK3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PARP4Q9UKK3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PARP4Q9UKK3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
PARP4Q9UKK3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PARP4Q9UKK3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms