Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms