Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2L0

WDR35, WD repeat-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR35Q9P2L0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
WDR35Q9P2L0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR35Q9P2L0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR35Q9P2L0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR35Q9P2L0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR35Q9P2L0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR35Q9P2L0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR35Q9P2L0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR35Q9P2L0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR35Q9P2L0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR35Q9P2L0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR35Q9P2L0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR35Q9P2L0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WDR35Q9P2L0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
WDR35Q9P2L0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WDR35Q9P2L0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
WDR35Q9P2L0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR35Q9P2L0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR35Q9P2L0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR35Q9P2L0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR35Q9P2L0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR35Q9P2L0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR35Q9P2L0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR35Q9P2L0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR35Q9P2L0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR35Q9P2L0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR35Q9P2L0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR35Q9P2L0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR35Q9P2L0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR35Q9P2L0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR35Q9P2L0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR35Q9P2L0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR35Q9P2L0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
WDR35Q9P2L0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR35Q9P2L0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR35Q9P2L0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR35Q9P2L0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR35Q9P2L0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR35Q9P2L0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR35Q9P2L0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR35Q9P2L0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR35Q9P2L0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR35Q9P2L0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR35Q9P2L0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR35Q9P2L0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR35Q9P2L0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR35Q9P2L0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR35Q9P2L0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR35Q9P2L0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR35Q9P2L0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR35Q9P2L0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.9 ms