Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDH10Q9P2E7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCDH10Q9P2E7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCDH10Q9P2E7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PCDH10Q9P2E7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PCDH10Q9P2E7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDH10Q9P2E7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDH10Q9P2E7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDH10Q9P2E7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDH10Q9P2E7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDH10Q9P2E7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDH10Q9P2E7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDH10Q9P2E7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDH10Q9P2E7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDH10Q9P2E7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDH10Q9P2E7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDH10Q9P2E7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDH10Q9P2E7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDH10Q9P2E7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDH10Q9P2E7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDH10Q9P2E7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDH10Q9P2E7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDH10Q9P2E7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDH10Q9P2E7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDH10Q9P2E7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms