Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CACNA2D2Q9NY47 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA2D2Q9NY47 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA2D2Q9NY47 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA2D2Q9NY47 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA2D2Q9NY47 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D2Q9NY47 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D2Q9NY47 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D2Q9NY47 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D2Q9NY47 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D2Q9NY47 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D2Q9NY47 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA2D2Q9NY47 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA2D2Q9NY47 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D2Q9NY47 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D2Q9NY47 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D2Q9NY47 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D2Q9NY47 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D2Q9NY47 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA2D2Q9NY47 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA2D2Q9NY47 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA2D2Q9NY47 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA2D2Q9NY47 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA2D2Q9NY47 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA2D2Q9NY47 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNA2D2Q9NY47 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms