Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BATF3Q9NR55 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BATF3Q9NR55 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BATF3Q9NR55 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BATF3Q9NR55 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms