Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GPHNQ9NQX3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPHNQ9NQX3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPHNQ9NQX3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPHNQ9NQX3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPHNQ9NQX3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPHNQ9NQX3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPHNQ9NQX3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPHNQ9NQX3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPHNQ9NQX3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPHNQ9NQX3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPHNQ9NQX3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPHNQ9NQX3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPHNQ9NQX3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPHNQ9NQX3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPHNQ9NQX3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPHNQ9NQX3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPHNQ9NQX3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPHNQ9NQX3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPHNQ9NQX3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GPHNQ9NQX3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPHNQ9NQX3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPHNQ9NQX3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPHNQ9NQX3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPHNQ9NQX3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPHNQ9NQX3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPHNQ9NQX3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GPHNQ9NQX3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GPHNQ9NQX3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GPHNQ9NQX3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GPHNQ9NQX3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPHNQ9NQX3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPHNQ9NQX3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPHNQ9NQX3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPHNQ9NQX3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPHNQ9NQX3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPHNQ9NQX3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPHNQ9NQX3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPHNQ9NQX3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPHNQ9NQX3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GPHNQ9NQX3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPHNQ9NQX3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPHNQ9NQX3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPHNQ9NQX3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPHNQ9NQX3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPHNQ9NQX3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPHNQ9NQX3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPHNQ9NQX3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPHNQ9NQX3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPHNQ9NQX3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPHNQ9NQX3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPHNQ9NQX3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPHNQ9NQX3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPHNQ9NQX3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GPHNQ9NQX3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GPHNQ9NQX3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPHNQ9NQX3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPHNQ9NQX3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPHNQ9NQX3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPHNQ9NQX3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPHNQ9NQX3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPHNQ9NQX3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPHNQ9NQX3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GPHNQ9NQX3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms