Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3P7

ACBD3, Golgi resident protein GCP60, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD3Q9H3P7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACBD3Q9H3P7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACBD3Q9H3P7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACBD3Q9H3P7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACBD3Q9H3P7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACBD3Q9H3P7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACBD3Q9H3P7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACBD3Q9H3P7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACBD3Q9H3P7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACBD3Q9H3P7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACBD3Q9H3P7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACBD3Q9H3P7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACBD3Q9H3P7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACBD3Q9H3P7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACBD3Q9H3P7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACBD3Q9H3P7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACBD3Q9H3P7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACBD3Q9H3P7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ACBD3Q9H3P7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACBD3Q9H3P7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACBD3Q9H3P7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACBD3Q9H3P7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACBD3Q9H3P7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACBD3Q9H3P7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACBD3Q9H3P7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACBD3Q9H3P7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACBD3Q9H3P7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACBD3Q9H3P7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACBD3Q9H3P7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACBD3Q9H3P7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACBD3Q9H3P7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACBD3Q9H3P7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACBD3Q9H3P7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms