Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
REXO4Q9GZR2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms