Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZCCHC2Q9C0B9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZCCHC2Q9C0B9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms