Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BARHL1Q9BZE3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BARHL1Q9BZE3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BARHL1Q9BZE3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms