Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC2Q9BYS8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC2Q9BYS8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC2Q9BYS8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC2Q9BYS8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC2Q9BYS8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC2Q9BYS8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC2Q9BYS8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC2Q9BYS8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC2Q9BYS8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC2Q9BYS8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC2Q9BYS8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC2Q9BYS8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC2Q9BYS8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRRC2Q9BYS8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRRC2Q9BYS8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRRC2Q9BYS8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC2Q9BYS8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC2Q9BYS8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC2Q9BYS8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms