Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PCGF6Q9BYE7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PCGF6Q9BYE7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
PCGF6Q9BYE7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PCGF6Q9BYE7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PCGF6Q9BYE7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PCGF6Q9BYE7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PCGF6Q9BYE7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PCGF6Q9BYE7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PCGF6Q9BYE7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PCGF6Q9BYE7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PCGF6Q9BYE7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PCGF6Q9BYE7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PCGF6Q9BYE7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PCGF6Q9BYE7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PCGF6Q9BYE7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PCGF6Q9BYE7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PCGF6Q9BYE7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PCGF6Q9BYE7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PCGF6Q9BYE7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PCGF6Q9BYE7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PCGF6Q9BYE7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PCGF6Q9BYE7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PCGF6Q9BYE7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
PCGF6Q9BYE7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PCGF6Q9BYE7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.49
PCGF6Q9BYE7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
PCGF6Q9BYE7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
PCGF6Q9BYE7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
PCGF6Q9BYE7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.3 ms