Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RSG1Q9BU20 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSG1Q9BU20 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms