Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GORASP1Q9BQQ3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GORASP1Q9BQQ3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GORASP1Q9BQQ3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.8 ms