Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRG3Q99928 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GABRG3Q99928 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABRG3Q99928 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GABRG3Q99928 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRG3Q99928 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRG3Q99928 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRG3Q99928 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRG3Q99928 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRG3Q99928 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRG3Q99928 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRG3Q99928 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRG3Q99928 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRG3Q99928 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRG3Q99928 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRG3Q99928 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRG3Q99928 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRG3Q99928 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRG3Q99928 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRG3Q99928 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRG3Q99928 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRG3Q99928 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRG3Q99928 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRG3Q99928 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRG3Q99928 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRG3Q99928 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRG3Q99928 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRG3Q99928 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRG3Q99928 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRG3Q99928 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABRG3Q99928 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GABRG3Q99928 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABRG3Q99928 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABRG3Q99928 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRG3Q99928 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.9 ms