Protein–RNA interactions for Protein: Q96S86

HAPLN3, Hyaluronan and proteoglycan link protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN3Q96S86 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HAPLN3Q96S86 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HAPLN3Q96S86 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms