Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ARXQ96QS3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ARXQ96QS3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ARXQ96QS3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ARXQ96QS3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ARXQ96QS3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ARXQ96QS3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ARXQ96QS3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ARXQ96QS3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ARXQ96QS3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ARXQ96QS3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ARXQ96QS3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ARXQ96QS3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ARXQ96QS3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
ARXQ96QS3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
ARXQ96QS3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ARXQ96QS3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ARXQ96QS3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ARXQ96QS3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ARXQ96QS3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ARXQ96QS3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ARXQ96QS3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ARXQ96QS3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ARXQ96QS3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ARXQ96QS3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ARXQ96QS3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ARXQ96QS3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ARXQ96QS3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ARXQ96QS3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ARXQ96QS3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
ARXQ96QS3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ARXQ96QS3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ARXQ96QS3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ARXQ96QS3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ARXQ96QS3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ARXQ96QS3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ARXQ96QS3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ARXQ96QS3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ARXQ96QS3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ARXQ96QS3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ARXQ96QS3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ARXQ96QS3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ARXQ96QS3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
ARXQ96QS3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ARXQ96QS3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ARXQ96QS3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ARXQ96QS3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
ARXQ96QS3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
ARXQ96QS3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
ARXQ96QS3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
ARXQ96QS3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms