Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT9

RNPC3, RNA-binding protein 40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3Q96LT9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RNPC3Q96LT9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNPC3Q96LT9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNPC3Q96LT9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNPC3Q96LT9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNPC3Q96LT9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNPC3Q96LT9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNPC3Q96LT9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNPC3Q96LT9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNPC3Q96LT9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RNPC3Q96LT9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNPC3Q96LT9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNPC3Q96LT9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNPC3Q96LT9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNPC3Q96LT9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNPC3Q96LT9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNPC3Q96LT9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNPC3Q96LT9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNPC3Q96LT9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNPC3Q96LT9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNPC3Q96LT9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNPC3Q96LT9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNPC3Q96LT9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNPC3Q96LT9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNPC3Q96LT9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNPC3Q96LT9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RNPC3Q96LT9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNPC3Q96LT9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms