Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAPNS2Q96L46 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPNS2Q96L46 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPNS2Q96L46 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPNS2Q96L46 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAPNS2Q96L46 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAPNS2Q96L46 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CAPNS2Q96L46 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAPNS2Q96L46 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAPNS2Q96L46 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAPNS2Q96L46 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAPNS2Q96L46 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAPNS2Q96L46 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAPNS2Q96L46 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAPNS2Q96L46 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAPNS2Q96L46 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAPNS2Q96L46 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAPNS2Q96L46 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPNS2Q96L46 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPNS2Q96L46 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPNS2Q96L46 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPNS2Q96L46 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPNS2Q96L46 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPNS2Q96L46 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPNS2Q96L46 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPNS2Q96L46 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPNS2Q96L46 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAPNS2Q96L46 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAPNS2Q96L46 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAPNS2Q96L46 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAPNS2Q96L46 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CAPNS2Q96L46 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAPNS2Q96L46 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAPNS2Q96L46 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CAPNS2Q96L46 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAPNS2Q96L46 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAPNS2Q96L46 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CAPNS2Q96L46 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAPNS2Q96L46 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAPNS2Q96L46 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAPNS2Q96L46 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAPNS2Q96L46 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAPNS2Q96L46 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAPNS2Q96L46 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPNS2Q96L46 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPNS2Q96L46 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPNS2Q96L46 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPNS2Q96L46 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPNS2Q96L46 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPNS2Q96L46 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPNS2Q96L46 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAPNS2Q96L46 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms