Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD3Q96L08 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SUSD3Q96L08 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms