Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CABS1Q96KC9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CABS1Q96KC9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.9 ms