Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NEURL4Q96JN8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NEURL4Q96JN8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NEURL4Q96JN8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NEURL4Q96JN8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NEURL4Q96JN8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
NEURL4Q96JN8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NEURL4Q96JN8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NEURL4Q96JN8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NEURL4Q96JN8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
NEURL4Q96JN8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
NEURL4Q96JN8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
NEURL4Q96JN8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
NEURL4Q96JN8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
NEURL4Q96JN8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
NEURL4Q96JN8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NEURL4Q96JN8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NEURL4Q96JN8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NEURL4Q96JN8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NEURL4Q96JN8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
NEURL4Q96JN8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
NEURL4Q96JN8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NEURL4Q96JN8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
NEURL4Q96JN8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NEURL4Q96JN8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NEURL4Q96JN8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NEURL4Q96JN8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NEURL4Q96JN8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NEURL4Q96JN8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
NEURL4Q96JN8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
NEURL4Q96JN8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NEURL4Q96JN8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NEURL4Q96JN8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
NEURL4Q96JN8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
NEURL4Q96JN8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NEURL4Q96JN8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NEURL4Q96JN8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NEURL4Q96JN8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NEURL4Q96JN8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NEURL4Q96JN8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NEURL4Q96JN8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NEURL4Q96JN8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
NEURL4Q96JN8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NEURL4Q96JN8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NEURL4Q96JN8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NEURL4Q96JN8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NEURL4Q96JN8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NEURL4Q96JN8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NEURL4Q96JN8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NEURL4Q96JN8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
NEURL4Q96JN8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NEURL4Q96JN8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NEURL4Q96JN8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NEURL4Q96JN8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NEURL4Q96JN8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NEURL4Q96JN8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NEURL4Q96JN8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NEURL4Q96JN8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NEURL4Q96JN8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NEURL4Q96JN8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NEURL4Q96JN8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms