Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMD3Q96D46 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NMD3Q96D46 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms