Protein–RNA interactions for Protein: Q92759

GTF2H4, General transcription factor IIH subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H4Q92759 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2H4Q92759 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2H4Q92759 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GTF2H4Q92759 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2H4Q92759 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2H4Q92759 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2H4Q92759 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2H4Q92759 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2H4Q92759 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2H4Q92759 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2H4Q92759 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2H4Q92759 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2H4Q92759 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2H4Q92759 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms