Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC12Q8WVT3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRAPPC12Q8WVT3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms