Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
RB1CC1Q8TDY2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC47.03■■■■■ 5.12
RB1CC1Q8TDY2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
RB1CC1Q8TDY2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC47.03■■■■■ 5.12
RB1CC1Q8TDY2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
RB1CC1Q8TDY2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
RB1CC1Q8TDY2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC47.01■■■■■ 5.12
RB1CC1Q8TDY2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC47.01■■■■■ 5.12
RB1CC1Q8TDY2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
RB1CC1Q8TDY2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
RB1CC1Q8TDY2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC47■■■■■ 5.11
RB1CC1Q8TDY2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47■■■■■ 5.11
RB1CC1Q8TDY2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC47■■■■■ 5.11
RB1CC1Q8TDY2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.98■■■■■ 5.11
RB1CC1Q8TDY2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.98■■■■■ 5.11
RB1CC1Q8TDY2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
RB1CC1Q8TDY2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC46.98■■■■■ 5.11
RB1CC1Q8TDY2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
RB1CC1Q8TDY2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
RB1CC1Q8TDY2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
RB1CC1Q8TDY2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC46.97■■■■■ 5.11
RB1CC1Q8TDY2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
RB1CC1Q8TDY2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC46.97■■■■■ 5.11
RB1CC1Q8TDY2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC46.97■■■■■ 5.11
RB1CC1Q8TDY2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.96■■■■■ 5.11
RB1CC1Q8TDY2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
RB1CC1Q8TDY2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
RB1CC1Q8TDY2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC46.93■■■■■ 5.1
RB1CC1Q8TDY2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
RB1CC1Q8TDY2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC46.93■■■■■ 5.1
RB1CC1Q8TDY2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
RB1CC1Q8TDY2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
RB1CC1Q8TDY2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
RB1CC1Q8TDY2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC46.91■■■■■ 5.1
RB1CC1Q8TDY2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
RB1CC1Q8TDY2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
RB1CC1Q8TDY2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC46.9■■■■■ 5.1
RB1CC1Q8TDY2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.9■■■■■ 5.1
RB1CC1Q8TDY2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC46.89■■■■■ 5.1
RB1CC1Q8TDY2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC46.89■■■■■ 5.1
RB1CC1Q8TDY2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC46.89■■■■■ 5.1
RB1CC1Q8TDY2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC46.89■■■■■ 5.1
RB1CC1Q8TDY2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
RB1CC1Q8TDY2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC46.88■■■■■ 5.1
RB1CC1Q8TDY2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
RB1CC1Q8TDY2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC46.87■■■■■ 5.09
RB1CC1Q8TDY2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
RB1CC1Q8TDY2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC46.87■■■■■ 5.09
RB1CC1Q8TDY2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC46.87■■■■■ 5.09
RB1CC1Q8TDY2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
RB1CC1Q8TDY2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC46.86■■■■■ 5.09
RB1CC1Q8TDY2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
RB1CC1Q8TDY2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
RB1CC1Q8TDY2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC46.85■■■■■ 5.09
RB1CC1Q8TDY2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC46.85■■■■■ 5.09
RB1CC1Q8TDY2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
RB1CC1Q8TDY2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC46.84■■■■■ 5.09
RB1CC1Q8TDY2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.84■■■■■ 5.09
RB1CC1Q8TDY2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC46.84■■■■■ 5.09
RB1CC1Q8TDY2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC46.84■■■■■ 5.09
RB1CC1Q8TDY2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC46.83■■■■■ 5.09
RB1CC1Q8TDY2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC46.83■■■■■ 5.09
RB1CC1Q8TDY2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
RB1CC1Q8TDY2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
RB1CC1Q8TDY2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC46.82■■■■■ 5.09
RB1CC1Q8TDY2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC46.82■■■■■ 5.09
RB1CC1Q8TDY2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC46.82■■■■■ 5.09
RB1CC1Q8TDY2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC46.81■■■■■ 5.08
RB1CC1Q8TDY2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
RB1CC1Q8TDY2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC46.81■■■■■ 5.08
RB1CC1Q8TDY2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
RB1CC1Q8TDY2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC46.81■■■■■ 5.08
RB1CC1Q8TDY2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC46.8■■■■■ 5.08
RB1CC1Q8TDY2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC46.8■■■■■ 5.08
RB1CC1Q8TDY2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.79■■■■■ 5.08
RB1CC1Q8TDY2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC46.79■■■■■ 5.08
RB1CC1Q8TDY2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC46.79■■■■■ 5.08
RB1CC1Q8TDY2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
RB1CC1Q8TDY2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
RB1CC1Q8TDY2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC46.78■■■■■ 5.08
RB1CC1Q8TDY2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
RB1CC1Q8TDY2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC46.77■■■■■ 5.08
RB1CC1Q8TDY2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.77■■■■■ 5.08
RB1CC1Q8TDY2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC46.77■■■■■ 5.08
RB1CC1Q8TDY2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC46.77■■■■■ 5.08
RB1CC1Q8TDY2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
RB1CC1Q8TDY2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
RB1CC1Q8TDY2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC46.76■■■■■ 5.08
RB1CC1Q8TDY2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC46.76■■■■■ 5.08
RB1CC1Q8TDY2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.76■■■■■ 5.08
RB1CC1Q8TDY2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.76■■■■■ 5.08
RB1CC1Q8TDY2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
RB1CC1Q8TDY2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.75■■■■■ 5.07
RB1CC1Q8TDY2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
RB1CC1Q8TDY2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC46.74■■■■■ 5.07
RB1CC1Q8TDY2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC46.74■■■■■ 5.07
RB1CC1Q8TDY2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC46.73■■■■■ 5.07
RB1CC1Q8TDY2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC46.73■■■■■ 5.07
RB1CC1Q8TDY2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC46.73■■■■■ 5.07
RB1CC1Q8TDY2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms