Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms