Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DTX3LQ8TDB6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DTX3LQ8TDB6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.6 ms