Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf43Q8TAL5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C9orf43Q8TAL5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms