Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHZ7

MBD3L2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L2Q8NHZ7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MBD3L2Q8NHZ7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MBD3L2Q8NHZ7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MBD3L2Q8NHZ7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MBD3L2Q8NHZ7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MBD3L2Q8NHZ7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MBD3L2Q8NHZ7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MBD3L2Q8NHZ7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MBD3L2Q8NHZ7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MBD3L2Q8NHZ7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MBD3L2Q8NHZ7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MBD3L2Q8NHZ7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MBD3L2Q8NHZ7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MBD3L2Q8NHZ7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MBD3L2Q8NHZ7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MBD3L2Q8NHZ7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
MBD3L2Q8NHZ7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MBD3L2Q8NHZ7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD3L2Q8NHZ7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms