Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY8

TMEM52, Transmembrane protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM52Q8NDY8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM52Q8NDY8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMEM52Q8NDY8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM52Q8NDY8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM52Q8NDY8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM52Q8NDY8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM52Q8NDY8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM52Q8NDY8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms